El reglamento financiero de la Conferencia de las Partes, sus órganos subsidiarios y la Secretaría del Convenio de Rotterdam fue aprobado en la primera reunión de la Conferencia de las Partes (decisión RC-1/4) y enmendado en la quinta reunión de la Conferencia de las Partes (decisión RC-5/1).
El reglamento financiero estipula, entre otras cosas, la elaboración de presupuestos, el establecimiento de un fondo fiduciario conforme a lo dispuesto en el Convenio, las contribuciones aportadas por las Partes, la gestión de las cuentas y las auditorías.