La parte de la FAO de la Secretaría del Convenio de Rotterdam está integrada a la División de Producción y Protección Vegetal de la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO). De esta manera, el trabajo sobre plaguicidas bajo el Convenio se beneficia de la cooperación con otros grupos de la FAO, por ejemplo con el equipo de gestión de plagas y plaguicidas. Para reducir el riesgo que presentan los plaguicidas para los consumidores y el medio ambiente, se desarrollan herramientas específicas para evaluar y registrar plaguicidas y se brinda asistencia para desarrollar la capacidad nacional en la gestión de plaguicidas y las obligaciones básicas en virtud del Convenio de Rotterdam.
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